Ngày 6 tháng 6 năm 2017, nhân ngày tưởng niệm những người lính Hàn Quốc đã hy sinh cuộc sống của họ vì lợi ích quê hương, Moon Jae-in đã có bài phát biểu gây tranh cãi tại nghĩa trang tưởng niệm quốc gia ở Seoul rằng nền kinh tế Hàn Quốc đã tồn tại được là nhờ vào "sự cống hiến to lớn và hy sinh vĩ đại của những người lính tham chiến tại Việt Nam".[32] Ngày 9/6, đại diện Bộ Ngoại giao Việt Nam đã giao thiệp nghiêm khắc với đại diện Đại sứ quán Hàn Quốc tại Việt Nam. Trong khi đó quân đội Đại Hàn trong thời gian tham chiến tại Việt Nam đã làm chết 9.000 người dân Việt Nam vô tội trong các cuộc thảm sát.[33]Ước tính có hàng trăm nghìn binh sĩ Hàn Quốc đã cùng với các lực lượng quân sự Hoa Kỳ tham chiến ở chiến trường Miền Nam Việt Nam.[34]
Tháng 1 năm 2019, thống đốctỉnhNam Gyeongsang là Kim Kyoung-soo, một đồng minh thân cận của Moon Jae-in bị kết án 2 năm tù vì đã thông đồng với một blogger tên Kim Dong-won, người có biệt danh là Druking, nhằm tăng số lượt "thích" trên các diễn đàn Internet, để qua đó tăng sự ủng hộ của người dân cho ông Moon, kết quả, blogger Kim đã bị kết án 3 năm rưỡi tù giam.[35]
Tháng 3 năm 2019, trong chuyến công du tới các nước Đông Nam Á, ông Moon đã liên tiếp phạm phải nhiều lỗi ngoại giao.[36]
